Portfólio individual

Catarina Carneiro

-» enzimar.team@gmail.com

1ºPeríodo:

Após algumas pesquisas sobre a enzima PON1, sobre os organofosfatos e outras coisas relacionadas com a execução do projeto, começaram a aparecer algumas dúvidas se o processo iria ser possível. Com tantas perguntas sem resposta decidimos falar com a nossa professora de Biologia e começar a procurar alguém com experiência na área para nos ajudar a perceber alguns assuntos mais técnicos e puder até vir a ser colaborador do nosso projeto.

Dia 11/10/2023:

Contactamos hoje, via email, a pessoa que, de todas as opções, parecia ser a que se enquadrava mais no nosso projeto, o Dr. Pedro Nuno Leão.

-»Procura de informação:

• https://revistagalileu.globo.com/Ciencia/Meio-Ambiente/noticia/2018/08/mamiferos-marinhos-pararam-de-produzir-enzima-essencial-para-protecao.html
• https://www.rcaap.pt/
• https://en.wikipedia.org/wiki/PON1
• https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6856225/
• https://pt.wikipedia.org/wiki/Composto_organofosforado
• https://en.wikipedia.org/wiki/Paraoxonase
• https://pt.wikipedia.org/wiki/%C3%89ster_fosfato
  

De dia 12/10/2023 a 28/11/2023:

Estamos a ficar um pouco desmotivados por ainda não termos obtido resposta do Dr.Pedro.

Dia 30/10/2023:

Hoje fomos fazer uma visita ao CIIMAR, local onde trabalha o Dr.Pedro Leão, para ver se era possível falar com ele. Infelizmente não o encontrámos mas conseguimos falar com a guia da visita que nos disse que ia encaminhar o nosso email para o Dr.Pedro. Ainda tinha esperança.

Dia 3/11/2023:

Obtivemos resposta!!!!!!!! Hoje de manhã, recebemos um email do Dr.Pedro Leão a dizer que achava o nosso projeto muito interessante e que estaria disponível para nos ajudar. Fiquei tão feliz por saber que o nosso projeto podia realmente se realizar. Agora temos de combinar um dia para fazermos a reunião online.

Dia 8/11/2023:

Hoje reunimo-nos com o Dr.Pedro Leão e com a nossa professora de biologia, Luísa Santos, numa reunião online para discutirmos aspetos importantes sobre o nosso projeto. Resumidamente, o Dr.Pedro gostou bastante da nossa ideia e pretende trabalhar connosco nos laboratórios do CIIMAR!!! Todo o grupo, incluindo a professora, ficou muito feliz com esta proposta única e estamos muito motivados para seguir em frente com o projeto.

(Reflexão pessoal: estava tão nervosa antes e durante a reunião que só conseguia sorrir para a câmara.)

-» Evidência da reunião:

Dias 15/11/2023 e 17/11/2023:

Aproveitamos estas duas tardes para tratar da parte teórica do projeto (vídeo de apresentação e documento word). Conseguimos adiantar bastantes coisas e finalizar o nosso logótipo.

De 19/11/2023 a 23/11/2023:

Estes dias foram um pouco caóticos, desde acabar o vídeo de apresentação a tratar dos requisitos para o Concurso Atlântico Júnior, que decidimos participar. Enquanto os meus colegas tratavam da parte mais informática, eu estive a ajudar no documento word juntamente com a minha outra colega, ver se estava tudo bem e se não faltava informação, e ajudei a recolher dados, procurar imagens e arranjar ideias para colocar no vídeo e o tornar mais dinâmico e interativo.

(Reflexão pessoal: com tantos trabalhos e testes de outras disciplinas e outros assuntos pessoais, foi bastante difícil conciliar tudo com todos os pormenores que necessitávamos para o vídeo de apresentação, mas no fim deu tudo certo.)

Dia 24/11/2023:

Como fiquei encarregue de fazer o site do projeto estive a ver algumas funcionalidades do google sites, plataforma que vamos utilizar, e já adiantei alguns aspetos importantes. Hoje acabámos também o vídeo e o documento word e enviámos para o Dr.Pedro Leão e para a professora, que está sempre a par de tudo o que fazemos, para darem a sua opinião.

-»Vídeo de apresentação (e o nosso canal de youtube):

Dia 30/11/2023:

Como não obtivemos resposta do Dr.Pedro e a data limite do “Prémio Atlântico Júnior” era hoje, fizemos a candidatura juntamente com a nossa professora Luísa. Continuo ainda a trabalhar no site, e espero tê-lo pronto até domingo.

(Reflexão pessoal: estou bastante entusiasmada com os concursos, porque nunca participei em algo parecido e acho genuinamente que o nosso projeto pode vir a ganhar.)

Dia 1/12/2023:

O Dr.Pedro respondeu ao email!! Disse-nos que os documentos de acesso ao concurso estavam muito bem e perguntou em que dia é que conseguíamos ir ao CIIMAR. Criei também uma conta de Instagram para a divulgação do nosso projeto.

(clicar aqui)

Dia 2/12/2023:

Respondemos ao email do Dr.Pedro, ficando combinada a ida ao CIIMAR dia 11.

(reflexão pessoal: estou tão nervosa para a reunião no CIIMAR, principalmente porque há possibilidades de a nossa professora não conseguir ir, então tenho medo de cairmos lá de paraquedas e não saber o que dizer/fazer). Mas claro que estou muito feliz porque agora é que tudo começa.)

Dia 4/12/2023:

Finalizei a estrutura do site do projeto. Pessoalmente acho que está bastante bonito.

Dia 11/12/2023:

Hoje fomos ao CIIMAR ter uma reunião presencial com o Pedro Leão. Falamos sobre o desenvolvimento do projeto e a forma como iremos trabalhar, tanto na parte das pesquisas como na parte prática. Ele também nos fez uma visita guiada ao edifício, mostrando também o laboratório onde vamos trabalhar, e apresentou-nos a Eunice, que é a cientista que nos vai ajudar e orientar no laboratório ao longo do projeto.

(reflexão pessoal: confesso que estava muito ansiosa e já estava a pensar em coisas como “Como é que o vou cumprimentar?”. Mas correu tudo muito bem e o Pedro é muito simpático. Acho que isto é realmente uma oportunidade única e sinto que vou adorar.)

PS:. O Pedro disse que íamos trabalhar como as pessoas que estão a tirar licenciatura :)

Dia 19/12/2023:

No dia 17, o Pedro mandou, por email, algumas tarefas de pesquisa que vão ser necessárias para o desenvolvimento do projeto, como “Que organofosfatos vamos usar?” e “Qual o melhor hospedeiro cianobacteriano a utilizar?”. Hoje comecei a investigar sobre todos os temas e arranjei imensa informação sobre organofosfatos, perigos e preços destes e sobre as duas cianobactérias que o Pedro sugeriu no email.

(Reflexão pessoal: ainda estou no início da pesquisa mas achei um pouco difícil encontrar todas as informações necessárias, principalmente quais são os organofosfatos mais utilizados. Sinto que este projeto também me está a ajudar bastante para o futuro na parte da informática, ao fazer o portfólio e a pesquisar informações em diversos sites mais profissionais, por exemplo.)

Dia 28/12/2023:

Após muitas pesquisas e recolha de informação, decidimos marcar uma reunião e ir ao CIIMAR. O Pedro e a Eunice ajudaram-nos muito, principalmente a direcionar a nossa pesquisa para uma parte mais específica, encontrar um par de enzima-substrato num conjunto de artigos. Também fomos apresentados ao resto da equipa que nos vai ajudar no projeto, o Paulo e a Amaranta. Ficámos até à noite a trabalhar em grupo para aproveitar.

(Reflexão pessoal: tenho achado bastante complicado ler e retirar informações de artigos científicos, porque têm muita informação e muitos termos que nós não entendemos.)

2º Período:

Dia 8/01/2024:

Reunimo-nos todos para concluir o trabalho de pesquisa que nos tinha sido pedido pelo Pedro. Individualmente estávamos todos preocupados porque achávamos que não tínhamos material suficientemente útil, mas afinal com a junção de tudo conseguimos fazer um bom trabalho e enviámos tudo por email para o Pedro e para a sua equipa.

Dia 10/01/2024:

Fomos ao CIIMAR mostrar tudo o que nos tinham pedido e o Pedro escolheu 3 dos muitos organofosfatos que lhe mostrámos, sendo a enzima que os hidrolisa a OPdA, agora é necessário procurar mais sobre os métodos utilizados nas experiências descritas nos artigos. Também tivemos a ajuda da Amaranta, da Eunice e do Paulo que nos fizeram ver as coisas em perspetivas diferentes, como por exemplo, duas maneiras de colocar a enzima no oceano: metermos a cianobactéria com a enzima no seu interior diretamente no oceano ou usarmos as cianobactérias para produzir a enzima que queremos e depois abrir as suas células para a retirar.

(Reflexão pessoal: ficámos novamente até tarde no CIIMAR, das 15h às 18h, e confesso que tem sido um pouco cansativo conciliar tudo do projeto com as restantes coisas, devido a andar de transportes públicos também. Mas sei que esta é a parte mais difícil e chata do projeto então não vou perder a motivação. Como a Eunice disse: “A seguir, na parte prática, vai ser mais divertido.”)

Dia 15/01/2024:

Recebemos uma ótima notícia: passámos à fase final do “Prémio Atlântico Júnior”!!! Ficámos muito felizes pois mostra o quão bom e importante para o ambiente o nosso projeto é e que as pessoas vêm o seu potencial.

Dia 17/01/2024:

Reunimo-nos no CIIMAR para apresentar as pesquisas que fizemos sobre os métodos analíticos referentes aos 3 pesticidas acordados (diazinon, chloropyrifos e paration) bem como os perigos associados a estes. O Pedro pediu-nos para encontrar artigos referentes ao método da cromatografia líquida mas o mais utilizado em quase todos os pdfs foi a cromatografia de gás. Com estas informações foi nos pedido para encontrarmos um gene que já estivesse presente numa cianobactéria já cultivada no CIIMAR, e após muitos “BLAST” no site NCBI encontramos 3 possíveis. Enviámos estas informações por email e estamos à espera da resposta do Pedro.

Começo prático do projeto:

Dia 7/02/2024:

Hoje, no CIIMAR estivemos a fazer pesquisas sobre o processo da biologia molecular (procurar termos como plasmídeo, vetor, etc) que vamos utilizar, e como o Pedro diz, é importante sabermos estes termos para quando formos para o laboratório não seja só fazer o que nos mandam mas sim perceber o que estamos a fazer.

(livros que o Pedro nos emprestou e que o ajudaram a concluir o curso)

Dia 8/02/2024:

Reunião com dois dos juízes do Prémio Atlântico Júnior para explicarmos como o projeto está a ser desenvolvido e sugestões para o produto final.

Dia 14/02/2024:

Hoje tivemos a formação de segurança laboratorial para podermos trabalhar neste. Achei interessante toda a informação que a senhora nos deu e estou MUITO motivada para passar finalmente à parte prática.

Dia 19/02/2024:

Na minha opinião, hoje foi o melhor dia do projeto até agora! Tivemos a desenhar com a Diana os primers que serão necessários para obtermos as enzimas pretendidas através das cianobactérias e achei tão interessante perceber como os primers funcionam e como os conseguimos obter. Usamos algumas plataformas adequadas mas o desenho foi feito no “Geneious”.

desenhos incríveis que a Diana fez para nós percebermos o processo

o nosso plasmídeo!!!! (ficou tão bonito)

De 21/02/2024 a 28/02/2024:

Nestes dias estivemos a tratar de todos os requisitos que são necessários para concorrermos ao concurso “The Challenge”. Eu fiquei encarregue de fazer um novo site, pois eles são exigentes com o que este deve conter. Foi bastante difícil começar porque todos os sites que me eram recomendados tinham algo pago. Para além disso, foi complicado conciliar o pouco tempo que tínhamos com ter de aprender do 0 a mexer na plataforma.

Dia 29/02/2024:

(clicar aqui)

Candidatamo-nos oficialmente ao concurso “The Challenge”!!!

Dia 11/03/2024:

Começamos hoje a parte prática do nosso projeto e fomos para o laboratório trabalhar! Estivemos com a Eunice a transferir o nosso plasmídeo para as células de E.coli, fazendo colónias destas, para conservá-lo e sempre que precisarmos termos em grandes quantidades.

Colónias de E.Coli

Plasmídeos: opdA e opdA_cyano

Protocolo laboratorial

Dia 13/03/2024:

Hoje estivemos a preparar tudo para fazer a técnica de PCR, que consiste em amplificar o ADN em várias temperaturas para saber depois qual é a mais eficaz para o nosso gene, e pipetamos muitas coisas de um lado para o outro! :)))

Protocolo laboratorial

Técnica PCR

Eu a pipetar plasmídeos para o interior de um tubo com água (estava demasiado concentrada, porque tinha medo de fazer algo mal)

Processo para certificar que fica tudo bem misturado

Dia 18/03/2024:

Hoje estivemos a fazer a técnica de eletroforese para verificar qual a melhor temperatura para amplificarmos o gene.

(Reflexão pessoal: tal como o Pedro disse, fazer a técnica de eletroforese é o momento em que nos sentimos realmente cientistas, com tanto cuidado e concentração)

Eu a pipetar o gene para dentro do gel da eletroforese

Resultados da eletroforese

Dias 25/03/2024 e 27/03/2024:

Nestes dias tive de me ausentar mas os meus colegas estiveram a repetir a técnica de PCR à temperatura ideal avaliada anteriormente, de modo a obterem uma maior quantidade e isolamento do gene desejado e fizeram a eletroforese para observar se havia alguma contaminação na amostra e para verificar se a amplificação tinha sido bem sucedida. E como estava tudo bem fizeram a purificação do ADN.

Resultado da eletroforese

Protocolo laboratorial

Dia 3/04/2024:

Hoje estivemos a medir a concentração de ADN e fizemos uma clonagem, juntando o plasmídeo obtido no PCR com o plasmídeo compatível com a cianobactéria que será inserido no seu interior, por complementaridade de bases.

Termomisturador

(achei imensa piada aos olhinhos)

Medição da concentração do ADN

Dia 4/04/2024:

Infelizmente hoje recebemos esta mensagem da Amaranta. Nem tudo na ciência dá certo à primeira por isso vamos tentar até resultar.

Dia 8/04/2024:

Soubemos que passamos à próxima fase do concurso “The Challenge” e vamos a BARCELONAAAA!!!

(Reflexão pessoal: estou tão entusiasmada com esta viagem, porque não só vai ser uma experiência incrível (conhecer pessoas de outros países, etc), como também vamos aprender bastante com as formações.)

Dia 10/04/2024:

Hoje tivemos uma reunião online com os organizadores do concurso “The Challenge” para esclarecer dúvidas e falar um pouco do que vamos fazer lá. (Estavam mais de 200 pessoas na reunião.)

Dia 16/04/2024:

Como da última vez não obtivemos colónias, hoje repetimos o processo com uma abordagem um pouco diferente descrita no protocolo abaixo.

PS.: hoje recebi um cartão temporário do CIIMAR e fiquei muito feliz e a sentir-me importante.

Eu e a Diana a medir a temperatura do banho-maria

Protocolo laboratorial

Eu super feliz a carregar gelo até ao frigorífico do andar -1 que está a -81ºC

Eu mais uma vez feliz com o meu cartãozinho do CIIMAR

Dia 17/04/2024:

Conseguimos obter colónias de E.Coli!!! Como este crescimento ainda não nos dá a certeza que as E.Coli cresceram com o nosso plasmídeo no interior das suas células, hoje estivemos a selecionar colónias isoladas daquelas que obtivemos para podermos verificar, através da técnica de PCR, se realmente o plasmídeo está inserido nas células de E.Coli.

(Reflexão pessoal: hoje foi um dia bastante interessante no laboratório, pois a Amaranta deixou-nos fazer a extração das colónias isoladas para os tubos de PCR, em chama!!!!

Colónias de E.Coli

Protocolo laboratorial

Marcação das colónias isoladas de E.Coli + tubos de PCR

PCR

Pipetar “NZYtaq”

Eu a fazer a extração das colónias isoladas para os tubos de PCR, a chama (que serve para certificar que nada ao seu redor fica contaminado)

22/04/2024:

Repetimos a eletroforese mas hoje foi para verificar se as colónias isoladas que extraímos de E.Coli tinham o nosso plasmídeo no seu interior: se desse perto das 2000 bases quereria dizer que tinham o comprimento do nosso plasmídeo e, consequentemente, o teriam no seu interior. Felizmente, foi possível observar nas imagens da eletroforese que todas as temperaturas usadas em PCR foram ideais.

Imagem controlo para interpretação das imagens da eletroforese

Resultado da eletroforese

24/04/2024:

Extraímos e isolamos o plasmídeo contido nas células de E.Coli e medimos a concentração de ADN do mesmo.

(Reflexão pessoal: infelizmente o horário da reunião do Campus de Barcelona coincidiu com o horário laboratorial, então a Eunice teve de adiantar alguns passos, mas explicou-nos tudo na mesma.)

Protocolo laboratorial

Tubos de conservação a -80ºC das colónias de E.Coli líquidas que contêm o plasmídeo no interior (OpdA_cyano e OpdA, respetivamente)

Tubos com o plasmídeo isolado + concentrações de ADN do mesmo

Colónias de E.coli concentradas no fundo do tubo

29/04/2024:

Hoje estivemos a transferir o nosso plasmídeo, isolado anteriormente, para as células de uma E.Coli específica para procedermos à técnica de conjugação (processo usado para transferir o plasmídeo contido na mesma para o interior da cianobactéria), esta foi a técnica escolhida de 2 outras, pois a cianobactéria que vamos utilizar só permite esta.

Placas de Petri antes e depois das colónias crescerem “over night”

Protocolo laboratorial

6/05/2024:

Hoje foi um dia mais tranquilo no laboratório, pois preparamos apenas os meios de cultura que iremos utilizar para a conjugação e colocamos estas amostras na autoclave, que serve para esterilizar os meios de cultura.

Protocolo Laboratorial

Soluções dos meio de cultura (a da direita apenas contém água e agar, pois estes não podem ser misturados com as outras)

Autoclave

De 8/05/2024 a 11/05/2024:

“The Challenge”- Campus Barcelona

Estes dias no campus foram incríveis, crescemos tanto não só como projeto mas também como pessoas. Sinto que saio desta experiência com mais confiança e com várias dicas que fomos aprendendo nos workshops. Fiz amizades inesperadas e saí bastante da minha zona de conforto. Só tenho a agradecer à professora e à Educoach, Ana, que acreditaram em nós e mantiveram-nos positivas. Sinto-me muito feliz por ter feito parte desta comunidade, vou ter saudades. Dia 16 vamos descobrir se vamos a Nova Iorque e a Boston apresentar o nosso projeto a entidades importantes.

Clique para ver o vídeo desta aventura em Barcelona

Dia 13/05/2024:

Voltamos ao laboratório e começamos por plaquear os meios de cultura, preparados anteriormente, em placas de Petri e na câmara de fluxo para evitar contaminações. Se tudo correr bem, quarta-feira já fazemos o processo de conjugação com a cianobactéria (ihihihihihihi!!!).

Placas de Petri com meio de cultura no interior da câmara de fluxo laminar

Nós e o íman que oferecemos de Barcelona ao CIIMAR

Eu muito feliz por estar a verter o líquido e a trabalhar na câmara de fluxo

Dias felizes no laboratório

Dia 15/05/2024:

Hoje foi o grande dia de fazer a conjugação com a cianobactéria. Descobrimos também que fomos selecionados para estar na Mostra Nacional de Ciência nos dias 23,24 e 25, pelo concurso dos “Jovens Cientistas”.

(Reflexão pessoal: a conjugação foi bastante interessante, pois nunca tínhamos trabalhado com cianobactérias e tivemos a oportunidade de fazer um pouco do processo prático e também de observar a cianobactéria no microscópio.)

Cianobactéria que vamos utilizar e câmara de fluxo laminar usada para evitar contaminações

Centrífuga

Máquina de limpeza ultrassónica

Imagens da cianobactéria em microscópio

Dia 16/05/2024:

Hoje descobrimos que passamos à fase final do concurso “The Challenge” e vamos a NOVA IORQUE E BOSTON e ainda apresentar o nosso projeto à ONU!!!! Estou tão feliz com esta notícia que sou capaz de gritar, isto é uma oportunidade única e é a primeira vez que uma escola portuguesa e uma escola pública passa a esta fase (e para ser ainda mais raro passaram 2 portuguesas, que por acaso quem passou connosco foi a equipa com quem nos demos melhor em Barcelona). Vou já fazer o passaporte!!!!!!!!!!!!!!!

(Fun fact: enquanto estava a decorrer a reunião para anunciar os prémios, estávamos a ter teste de matemática, então só soubemos depois.)

De 23/05/2024 a 25/05/2024:

Mostra Nacional de Ciência- “Jovens Cientistas”

Estes dias na Alfândega do Porto foram um pouco cansativos mas gostei imenso de ter a nossa barraquinha e decorá-la. Apresentamos o projeto a bastantes pessoas e também a júris.

Dia 29/05/2024:

Hoje tivemos uma apresentação para a equipa do laboratório CNP (Cyanobacterial Natural Products), laboratório onde trabalhamos no CIIMAR, e falamos um pouco de toda a experiência em Barcelona e também de como chegamos ao Dr.Pedro Leão e como está a correr o projeto. Estava bastante nervosa porque a apresentação teve de ser em inglês dado o facto de que nem todos os que trabalham no laboratório falam português, mas acho que correu bem e as pessoas deram-nos confiança e conforto. Senti-me feliz por acharem o nosso projeto interessante e compararem com projetos de mestrado. Ouvimos palavras muito bonitas vindas dos membros da equipa e sentimo-nos mais incluídos.

(Fun fact: eles chamam-nos “The kids” ahahahhah)

Dia 03/06/2024:

Mudança de placas das colónias de cianobactérias possivelmente transformadas.

Placas das colónias e as que iremos utilizar para a mudança

Eu a plaquear

Eunice a “lavar” as cianobactérias

Dia 04/06/2024:

Estas 2 semanas têm sido para terminar os trabalhos para avaliação, mas como o Dr. Pedro disse que podíamos continuar a trabalhar no projeto, no CIIMAR, depois da escola acabar, não pretendo dar como terminado este longo e trabalhoso portfólio. Com isto, gostaria de agradecer a todos aqueles que fizeram o “EnziMar” acontecer e por acreditarem em mim. Aprendi muito e levarei este projeto para toda a minha vida (e todas as noites sem dormir e horas a fio no computador compensaram). Um beijo grande e vemo-nos daqui a uns dias!

Fim do ano letivo (mas não é o fim do EnziMar) !!!

De 31/06/2024 a 12/07/2024:

“The Challenge”- Viagem formativa a Nova Iorque e Boston

Ainda nem consigo acreditar que embarquei nesta viagem de sonho. Tudo o que passei ​nestes dias mudaram definitivamente a minha visão do futuro e da pessoa que quero ser, não ​só pelas pessoas de referência com quem tivemos oportunidade de falar mas também por ​todas as experiências que nos foram proporcionadas. Visitei locais que nunca imaginei sequer ​visitar com 18 anos e vivi o tão falado sonho americano. O “The Challenge” ensinou me a ser ​uma pessoa melhor e mais comunicativa, sair da minha zona de conforto, que às vezes é ​demasiado confortável, a não ter medo de arriscar e acreditar em mim. Tinha demasiado ​medo de falar em público e agora até às Nações Unidas apresentei o meu projeto. A verdade ​é que soube agarrar esta oportunidade única que me foi proporcionada, aprendi, aproveitei e ​fui feliz. Fiz amigos que nunca pensei que ia fazer e criei memórias que nunca vou esquecer. E ​para acabar da melhor forma, aqui vai a pergunta que estremecia a multidão do “The ​Challenge”:

QUE SOMOS?

WORLDSHAKERSSSS!!!!!

Apresentação às Nações Unidas no consulado ​geral de Espanha em Nova Iorque

Equipa na sede das Nações Unidas, NY

Equipa no MIT, Massachusetts

Notícia no site do CIIMAR